Fiche TD avec le logiciel tdr16

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  • fiche - matière potentielle : td

  • fiche - matière potentielle : td avec le logiciel


Fiche TD avec le logiciel : tdr16 ————— Installer des donnees volumineuses : les genomes bacteriens J.R. Lobry & D. Chessel ————— Pour tester l'aptitude de R a manipuler de grands ensembles de donnees, la fiche propose d'implanter un tableau sequences - codons de taille respectable. Table des matieres 1 Introduction 2 2 Les donnees 3 3 Importer un grand tableau 5 4 Sauver et restaurer un grand tableau 5 5 Taille memoire 6 6 Tableaux derives 6 6.1 Creer le tableau especes-codons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 6.2 Creer le tableau sequences-acides amines . . . . . . . . . . . . . . 8 6.3 Creer le tableau especes-acides amines . . . . . . . . . . . . . . . 8 6.4 Creer le tableau sequences-bases . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 6.5 Creer le tableau especes-bases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 7 Exercices 10 References 11 1

  • deirac1 deinococcus radiodurans

  • mitochondrial code

  • blepharisma nuclear

  • code standard

  • halspp2 halobacterium sp

  • complete genome

  • genome

  • code

  • donnees


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Français

Fiche TD avec le logiciel :tdr16 ————— Manipuler des données volumineuses : les génomes bactériens
J.R. Lobry & D. Chessel —————
Pour tester l’aptitude de R à manipuler de grands ensembles de données, la fiche propose d’implanter un tableau séquences  codons de taille respectable.
Table des matières
1 Introduction
2 Les données
3 Importer un grand tableau
4 Sauver et restaurer un grand tableau
5 Taille mémoire
6 Tableaux dérivés 6.1 Créer le tableau espècescodons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6.2 Créer le tableau séquencesacides aminés . . . . . . . . . . . . . . 6.3 Créer le tableau espècesacides aminés . . . . . . . . . . . . . . . 6.4 Créer le tableau séquencesbases . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6.5 Créer le tableau espècesbases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
7 Exercices
Références
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2
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4
5
6
6 7 7 8 8 9
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