Epidémiologie clinique de la prise en charge des patients co-infectés par le VIH et le virus de l’hépatite C à partir des cohortes ANRS CO 03 Aquitaine et ANRS CO 13 HEPAVIH

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Université Victor Ségalen Bordeaux 2
Année 2009 Thèse n° 1693
THESE
Pour le
DOCTORAT DE L’UNIVERSITE BORDEAUX 2
Mention : Sciences Biologiques et Médicales
Option : Epidémiologie et Intervention en Santé Publique

Présentée et soutenue publiquement
Par
Marc-Arthur Loko
Le
17 Décembre 2009

Epidémiologie clinique de la prise en charge des patients
co-infectés par le VIH et le virus de l’hépatite C à partir des
cohortes ANRS CO 03 Aquitaine et ANRS CO 13 HEPAVIH

Membres du jury

Mr Rachid Salmi, Professeur, Bordeaux, France Président
Mr Fabrice Carrat, Professeur, Paris, France Rapporteur
Mr Lionel Piroth, Professeur, Dijon, France Rapporteur
Me Dominique Salmon-Ceron, Professeur, Paris, France Examinateur
Mr Victor De-Ledinghen, Professeur, Bordeaux Examinateur
Mr Didier Neau, Professeur, Bordeaux, France Directeur
Mr François Dabis, Bordeaux, France Co-directeur
2 Remerciements
REMERCIEMENTS

A Monsieur Lionel Piroth,
Vous m’avez fait l’honneur d’avoir accepté d’être le rapporteur de cette thèse. Je tiens à vous exprimer
toute ma reconnaissance.

A Monsieur Fabrice Carrat,
Je vous remercie infiniment d’avoir accepté d’être rapporteur de cette thèse. Je suis très honoré que vous
ayez bien voulu apporter à ce travail votre expertise d’épidémiologiste.

A Monsieur Rachid Salmi,
Merci infiniment, malgré votre agenda chargé, d’avoir accepté de présider ce jury.

A Mme Dominique Salmon,
Mes remerciemnts les plus sincères pour avoir avoir accepté de faire partie de ce jury.

A Monsieur Victor De-Ledinghen,
Je suis très sensible à l’honneur que vous me faites en acceptant de faire partie du jury de cette thèse.
Veuillez recevoir mes plus vifs remerciements.

A Monsieur François Dabis,
Je vous remercie de m’avoir motivé à préparer cette thèse et de m’avoir suivi tout au long de sa
réalisation.

A Monsieur Didier Neau,
Je vous remercie d’avoir accepté de diriger ce travail. Grâce à votre disponibilité et votre rigueur, ce
travail a pu aboutir. Je vous en suis très reconnaissant.

A Mme Geneviève Chêne,
Je vous remercie pour la confiance que vous m’avez accordée en m’accueillant dans votre équipe.

A l’équipe HEPAVIH,
Vous m’avez permis pendant de longs mois d’être moins souvent impliqué dans la gestion quotidienne de
la cohorte. Vos encouragements et votre soutien moral ne m’on jamais maqnués. Je vous en remercie.
3 Table des matières
Table des matières
Introduction
Chapitre 1 : Etat actuel des connaissances
I L’hépatite C chez le patient immunocompétent -------------------------------------------------------------------------- 12
I.1 Le virus de l’hépatite C------------------------------------------------------------------------------------------------ 12
I.1.1 Structure-------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 12
I.1.2 Le diagnostic virologique de l’infection par le VHC --------------------------------------------------------- 14
I.2 Histoire naturelle de l’infection par le VHC ----------------------------------------------------------------------- 15
I.2.1 Modes de transmission--------------------------------------------------------------------------------------------- 17
I.2.2 L’infection aiguë---------------------------------------------------------------------------------------------------- 18
I.2.3 L’infection chronique ---------------------------------------------------------------------------------------------- 19
I.2.4 Réponse immune contre le VHC--------------------------------------------------------------------------------- 25
I.2.5 La fibrose hépatique au cours de l’infection par le VHC ---------------------------------------------------- 27
I.3 Traitement de l’hépatite C chez le patient immunocompétent-------------------------------------------------- 30
II L’hépatite C chez le patient infecté par le VIH --------------------------------------------------------------------------- 31
II.1 Epidémiologie de la co-infection par le VIH et le VHC --------------------------------------------------------- 31
II.2 Histoire naturelle de la co-infection par le VIH et le VHC------------------------------------------------------ 33
II.2.1 Influence de l’infection par le VIH sur l’histoire naturelle de l’infection par le VHC -------------- 33
II.2.2 Influence de l’infection par le VHC sur l’histoire naturelle de l’infection par le VIH -------------- 44
II.3 Foie et traitement antirétroviral -------------------------------------------------------------------------------------- 46
II.3.1 Incidence de l’ hépatotoxicité des antirétroviraux--------------------------------------------------------- 46
II.3.2 Mécanismes de l’ hépatotoxicité des antirétroviraux ----------------------------------------------------- 47
II.3.3 L’hépatotoxicité des principales classes médicamenteuses ---------------------------------------------- 49
II.4 Traitement de l’hépatite C chez le patient infecté par le VIH--------------------------------------------------- 52
II.4.1 Efficacité du traitement contre le VHC chez le patient infecté par le VIH---------------------------- 52
II.4.2 Tolérance du traitement contre le VHC chez le patient infecté par le VIH --------------------------- 53
III Stéatose hépatique et co-infection VIH-VHC ------------------------------------------------------------------------- 55
III.1 Définition ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 55
III.2 Mécanismes ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 57
III.3 Prévalence --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 58
III.4 Relation entre stéatose et fibrose hépatique------------------------------------------------------------------------ 59
IV Evaluation de la fibrose hépatique -------------------------------------------------------------------------------------- 61
IV.1 La ponction-biopsie hépatique (PBH) ------------------------------------------------------------------------------ 61
IV.1.1 Risques et inconvénients de la PBH ------------------------------------------------------------------------- 62
IV.1.2 Limites de la performance de la PBH ----------------------------------------------------------------------- 63
IV.2 Les marqueurs sériques non invasifs de fibrose------------------------------------------------------------------- 64
IV.2.1 Les marqueurs indirects de fibrose--------------------------------------------------------------------------- 65
IV.2.2 Les marqueurs directs de fibrose ----------------------------------------------------------------------------- 68
IV.2.3 Les scores ou tests sériques de fibrose au cours de la mono-infection par le VHC------------------ 70
IV.2.4 Les scores ou tests sériques de fibrose au cours de la co-infection par le VIH et le VHC --------- 71
IV.3 L’élastométrie (FibroScan)----------------------------------------------------------------------------------------- 74
IV.4 Les limites de l’interprétation des scores non-invasifs de fibrose---------------------------------------------- 75
IV.4.1 Les limites liées à la biopsie hépatique---------------------------------------------------------------------- 75
IV.4.2 Les limites liées au dosage des marqueurs sériques------------------------------------------------------- 77
IV.4.3 Les limites liées à la construction des scores sériques ---------------------------------------------------- 78

Chapitre 2 : Présentation des cohortes ANRS CO 13 Hepavih et ANRS CO3 Aquitaine
I La cohorte ANRS CO 13 HEPAVIH--------------------------------------------------------------------------------------- 84
I.1 Objectifs------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 84
I.1.1 Objectif général ----------------------------------------------------------------------------------------------------- 84
I.1.2 Objectifs spécifiques ----------------------------------------------------------------------------------------------- 85
I.2 Méthodes----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 87
I.2.1 Critères d’inclusion------------------------------------------------------------------------------------------------- 87
I.2.2 Schéma d’étude et modalités de suivi --------------------------------------------------------------------------- 87
I.2.3 Données recueillies------------------------------------------------------------------------------------------------- 89
I.3 Bilan