Interactions pour la lumière entre les arbres adultes, les jeunes arbres et la végétation du sous-bois au sein d'un écosystème forestier : application à la régénération du pin sylvestre en peuplement mélangé chêne sessile - pin sylvestre, Light interactions within a forest ecosystem between the adult trees, the young trees and the understorey vegetation

UNIVERSITÉ D’ORLÉANS



ÉCOLE DOCTORALE SCIENCES ET TECHNOLOGIES
Unité de recherche « Ecosystèmes Forestiers » - CEMAGREF

THÈSE présentée par :
Noémie GAUDIO


soutenue le : 19 novembre 2010

pour obtenir le grade de : Docteur de l’université d’Orléans
Discipline : Biologie Forestière


Interactions pour la lumière au sein d’un écosystème
forestier entre les arbres adultes, les jeunes arbres et
la végétation du sous-bois.
- application à la régénération du pin sylvestre en peuplement
mélangé chêne sessile – pin sylvestre -

THÈSE dirigée par :
Philippe BALANDIER CR / HDR, Cemagref Nogent - INRA Clermont-Ferrand

RAPPORTEURS :
Bernard PREVOSTO Ingénieur / HDR, Cemagref Aix-en-Provence
Jean-Claude GEGOUT Professeur / HDR, AgroParisTech Nancy
_________________________________________________________________

JURY :
Franck BRIGNOLAS Professeur / HDR, Université d’Orléans INRA, président du jury
Bernard PREVOSTO Ingénieur / HDR, Cemagref Aix-en-Provence
Jean-Claude GEGOUT Professeur / HDR, AgroParisTech Nancy
Philippe LEJEUNE Professeur, Université de Gembloux
Hendrik DAVI CR, INRA Avignon
Philippe BALANDIER CR / HDR, Cemagref Nogent – INRA Clermont-Ferrand


tel-00587487, version 1 - 20 Apr 2011


tel-00587487, version 1 - 20 Apr 2011REMERCIEMENTS

Durant ces trois années de thèse, financées par la région Centre et le Cemagref, j’ai non seulement
découvert l’écologie forestière, une discipline scientifique absolument passionnante, mais en plus, j’ai
eu la chance de faire cette découverte dans de bonnes conditions, que ce soit d’un point de vue
professionnel ou humain. Je tiens donc à remercier ici toutes les personnes qui ont participé à cette
aventure tellement enrichissante.

Tout d’abord, je remercie profondément Philippe Balandier, mon directeur de thèse, qui a cru en moi
et qui m’a encadrée et aidée tout au long de ce travail, et ce en faisant preuve d’une extrême
disponibilité et de très grandes qualités humaines. Merci d’avoir toujours su me « booster » quand il le
fallait ou me rassurer quand je flanchais, de m’avoir laissé une grande autonomie de travail. J’ai aimé
cette capacité à expliquer des notions complexes de manière simple, rendant toujours accessible ce que
tu voulais faire passer, qualité d’ailleurs reconnue par l’ensemble des personnes qui travaillent avec
toi. Merci aussi pour toutes les possibilités que tu m’as données de rencontrer des gens dans le grand
réseau international de notre domaine. Ça a vraiment été un immense plaisir de travailler avec toi !

Merci aussi à l’équipe Forêts Hétérogènes du Cemagref de Nogent, à Thomas Pérot et à Patrick
Vallet, pour leur bonne humeur au quotidien, pour leur disponibilité pour m’expliquer notamment les
bases de la modélisation qui étaient pour moi assez obscures (ainsi que tous les secrets de Word…ça a
du bon le service militaire !) ; à Yann Dumas et Sandrine Perret, un couple absolument formidable
et passionné de la forêt, qui m’ont aidée du début à la fin pour toutes les manips’ de terrain, qui m’ont
formée sur la sylviculture et tellement d’autres choses ; à Vincent Seigner, technicien et ami, qui a
pris les choses en main dès qu’il est arrivé, me soulageant ainsi d’une lourde organisation, et puis
merci aussi à ses deux femmes, Jade et Josée, pour ces apéros sympas et ces magnifiques sculptures en
pâte toute colorée parce que dans la vie, il n’y a pas que le boulot ! ; à Michel Bonin, toujours là, qu’il
pleuve qu’il vente ou qu’il neige pour faire des tâches pour lesquelles seul lui avait la patience
nécessaire ; à Gwenaël Philippe (mon compagnon des pauses clopes !), pour ces discussions
enrichissantes et ce regard critique ; à Christian Ginisty enfin, le chef de cette petite équipe, qui m’a
toujours permis de faire ce que je voulais même si c’était parfois un peu « rock’n’roll ». Merci aussi à
tout le petit monde du bâtiment des Pommiers, Stéfouille (héhé), Sonia, Catherine, Pascal, Vincent,
Patrick (le savant fou), Eric, Isabelle, Nathalie…vous avez permis des pauses café (je n’oublierai
jamais le cri de Thomas par la petite fenêtre du haut) bien sympas et pleines de bonne humeur ! Je
remercie particulièrement le personnel du garage, Daniel Moreau et Franck Stocchero – des
MacGyver des temps modernes ! – ainsi que Gilles Bergevin et Philippe Guillemard, les
informaticiens qui sont venus si souvent me donner un coup de main, et Josette Baptiste et Sylvie
Bourgeois, toujours sympas et de bonne humeur même si je donnais mes ordres de mission en retard
une fois sur deux !

Merci à tous les stagiaires et vacataires qui m’ont aidée dans mes lourdes manips’ de terrain, toujours
dans la bonne humeur quels que soient le temps et les horaires de travail. Je tiens ici à particulièrement
remercier Aurélien Brochet, un stagiaire, puis vacataire, hors du commun ! Nous avons travaillé
ensemble pendant une saison entière, la plus dure que j’ai faite durant ces trois années à cause des
nombreuses mesures réalisées à des heures incongrues. On a d’ailleurs fini sur les rotules ! Mais tout
ça s’est fait en rigolant. J’ai alors rencontré un gars extrêmement compétent sur le terrain, méticuleux,
curieux, drôle, et par là même, une belle amitié. Je pense aussi à Florian Vast et à nos longues
journées de prospection qui n’en finissaient pas et au bout desquelles on rentrait parfois bredouilles
(ah l’angoisse !), ainsi qu’aux multiples fois où nous nous sommes embourbés (sans compter celle où
nous étions sur un GR…hum hum !). Merci d’avoir toujours cru à ce que je faisais et tu as su me
remonter le moral à un moment où beaucoup de gens pensaient que je me lançais dans quelque chose
d’impossible : « T’inquiète, on va y arriver… » Et tu avais raison !
Merci aussi à Emmanuelle Lancelle, volontaire et sympathique, à Antoine Metelli et à Vincent
Lefort, collègues de travail le jour, et potes dès la nuit tombée !


tel-00587487, version 1 - 20 Apr 2011Merci enfin à tout le personnel du Cemagref car il est rare je pense d’arriver dans un lieu et de s’y
sentir intégrée sans aucun problème. Le centre de Nogent est un îlot de bonne humeur !
Merci également à tous ceux qui ont fait que la vie passait vite et était bien remplie ! à tous les gens
avec qui j’ai fait des fiesta sur place (ah là là…ils étaient beaux les jeudis soirs !), à Yoan, Caro (et
ses « pisse mémé »), Aurore, Vincent le doc’, Aurélie, Hélène, Olivier…on a passé des sacrées
soirées ! à Hilaire, pour ces midis piscine (ça fait du bien !).

J’ai également passé les six derniers mois de ma thèse à l’INRA de Clermont (UMR PIAF), pour
pouvoir rédiger en étant proche de Philippe, mon directeur de thèse. J’ai alors retrouvé une équipe que
je connaissais déjà et que j’ai découverte lors de mon DEA. Et là aussi, ce sont de joyeux lurons ! Je
remercie particulièrement Thierry Ameglio et Jean-Louis Julien qui ont accepté de m’héberger
pendant ces six mois, et Alexandre Leca, qui m’a fait une place dans son bureau (et ce n’est pas rien
vu comme je suis ordonnée !). Je tiens ici à particulièrement remercier l’équipe AMI, constituée de
personnes qui sont drôles et qui s’entendent bien, ce qui participe à une vraiment bonne ambiance de
travail ; merci en particulier à Nicolas Donès qui m’a offert son aide pour l’implémentation du modèle
RReShar (ouf ! je vois pas trop comment j’aurais fait sinon) ; à Marc Saudreau pour sa disponibilité
et ses conseils sur les données température ; à André Marquier qui m’a dépannée à plusieurs reprises
pour des manips’ de terrain, notamment pour tout ce qui a trait aux mesures de LMA (merci aussi à
Christophe Serre et Stéphane Ploquin !) et à la cartographie des peuplements ; à Boris Adam, qui
crée par magie des petits logiciels qui facilitent tellement la vie ! Pendant ces six mois qui ont été
intenses et stressants au niveau boulot, j’ai redécouvert Dominique Tiziani, la secrétaire et protectrice
du PIAF, et alors là, c’était vital au niveau moral. Donc Dom’, je te dis merci pour tout, pour ces
discussions, pour ces bonnes tranches de rigolade, pour la découverte des cigarillos et pour tout le
reste. Merci aussi aux stagiaires